Luego de la correcta selección de un sitio, el aspecto más importante es la concepción y desarrollo de un proyecto de diseño de infraestructura que provea un nivel de seguridad acorde con el objetivo de protección definido para el establecimiento, pero además, los sistemas de protección que se consideren deberán ser factibles de construir y susceptibles de un mantenimiento efectivo.
A partir del programa arquitectónico se elabora un anteproyecto en el cual se define cómo se organizarán los servicios y los espacios, además que se establece la forma y funcionamiento del establecimiento de salud.